Šilumos dviratininkai, dar žinomi kaip PGR mašinos, yra svarbios molekulinės biologijos ir genetikos tyrimų įrankiai. Šie instrumentai naudojami DNR ir RNR amplifikavimui naudojant polimerazės grandininės reakcijos (PGR) technologiją. Tačiau šiluminių dviračių universalumas neapsiriboja PGR taikymu. Šiame straipsnyje mes išnagrinėsime įvairius būdus, kaip šiluminiai dviračiai naudojami atliekant tyrimus ir jų svarbą tobulinant mokslo žinias.
1. PGR amplifikacija
Pagrindinė a funkcijaŠiluminis dviratisyra atlikti PGR amplifikaciją, kuri yra labai svarbi įvairiems molekulinės biologijos pritaikymams. Atliekant DNR ar RNR mėginį į temperatūros pokyčius, šiluminiai ciklai skatina nukleorūgščių sruogų denatūraciją, atkaitinimą ir pratęsimą, todėl eksponentinė amplifikacija amplifikuoja specifines tikslines sekas. Šis procesas yra labai svarbus genetinei analizei, genų ekspresijos tyrimams ir infekcinių agentų aptikimui.
2. Kiekybinė PGR (qPCR)
Be standartinio PGR, kiekybiniam PGR arba qPCR yra naudojami šiluminiai ciklai, leidžiantys kiekybiškai įvertinti nukleorūgšties taikinius mėginyje. Įtraukdami fluorescencinius dažus ar zondus, šiluminiai ciklai gali išmatuoti PGR produktų kaupimąsi realiuoju laiku, suteikdama vertingų įžvalgų apie genų ekspresijos lygį, viruso apkrovą ir genetinius variacijas.
3. Atvirkštinė transkripcijos PGR (RT-PGR)
Šilumos dviratininkai vaidina gyvybiškai svarbų vaidmenį atvirkštinės transkripcijos PGR - technikoje, kuri RNR paverčia papildomu DNR (cDNR), kad būtų galima vėliau amplifikuoti. Šis metodas yra labai svarbus tiriant genų ekspresiją, RNR virusus ir mRNR sujungimo modelius. Šiluminis dviratis su tikslia temperatūros kontrole yra labai svarbi RT-PGR eksperimentų sėkmei.
4. Skaitmeninis PGR
Šiluminio ciklo technologijos pažanga lėmė skaitmeninės PGR sukūrimą - labai jautrų metodą, skirtą absoliučiai kiekybiškai įvertinti nukleorūgščių kiekį. Padaliję PGR reakciją į tūkstančius atskirų mikroreaktikų, šiluminiai ciklai gali tiksliai nustatyti pradinę tikslinės molekulės koncentraciją, todėl skaitmeninis PGR yra vertingas įrankis retųjų mutacijų aptikimo ir kopijų skaičiaus variacijų analizei.
5. Naujos kartos sekos bibliotekų paruošimas
Šilumos dviračiai yra neatsiejama bibliotekos paruošimo proceso dalis naujos kartos sekos nustatymo (NGS) programoms. Atlikdami PGR pagrįstą DNR fragmentų amplifikaciją, šiluminiai dviračiai leidžia konstruojant sekos bibliotekas iš ribotos pradinės medžiagos, leisdama tyrėjams analizuoti visą organizmo genomą, transkriptą ar epigenomą.
6. Baltymų inžinerija ir mutagenezė
Be nukleorūgščių amplifikacijos, šiluminiai ciklai naudojami baltymų inžinerijos ir mutagenezės tyrimuose. Vietą nukreipta mutagenezė, baltymų ekspresijos optimizavimas ir nukreipti evoliucijos eksperimentai dažnai priklauso nuo PGR pagrįstų metodų, o šiluminiai dviračiai, turintys tikslią temperatūros kontrolę, vienodą šildymo ir aušinimo greitį, yra labai svarbūs norint gauti tikslius ir atkuriamus rezultatus.
7. Aplinkos ir maisto saugos bandymai
Šilumos dviračiai taip pat naudojami atliekant aplinkos ir maisto saugos bandymus, ypač nustatant mikrobų patogenus, genetiškai modifikuotus organizmus (GMO) ir maisto plintančius patogenus. PGR pagrįsti testai, vykdomi šiluminiuose dviratininkuose, leidžia greitai ir specialiai identifikuoti teršalus, užtikrinančius maisto ir aplinkos mėginių saugumą ir kokybę.
Apibendrinant,Šilumos dviračiaiyra nepakeičiamos molekulinės biologijos ir genetikos tyrimų įrankiai, užtikrinantys platų taikymo spektrą, viršijantį tradicinį PGR amplifikaciją. Dėl jų universalumo ir tikslumo jie yra gyvybiškai svarbūs eksperimentams, pradedant genų ekspresijos analize ir baigiant aplinkos stebėjimu. Tobulėjant technologijoms, šiluminiai dviračiai greičiausiai vaidins vis svarbesnį vaidmenį skatinant mokslinius atradimus ir naujoves.
Pašto laikas: 2014 m. Liepos 11 d