Kiek sumažėjo Omikrono toksiškumas? Keli realaus pasaulio tyrimai rodo

„Omikrono virulentiškumas yra artimas sezoninio gripo virulentiškumui“ ir „Omikronas yra žymiai mažiau patogeniškas nei Delta“. ... Pastaruoju metu internete plinta daug naujienų apie naujos karūnos mutantinės padermės Omikrono virulentiškumą.

Iš tiesų, nuo Omikrono mutantinės padermės atsiradimo 2021 m. lapkritį ir jos paplitimo visame pasaulyje, virulentiškumo ir perdavimo tyrimai bei diskusijos tęsėsi nepaliaujamai. Koks yra dabartinis Omikrono virulentiškumo profilis? Ką apie jį sako tyrimai?

Įvairūs laboratoriniai tyrimai: Omikronas yra mažiau virulentiškas
Iš tiesų, jau 2022 m. sausio mėn. Honkongo universiteto Li Ka Shing medicinos fakulteto atliktas tyrimas parodė, kad Omicron (B.1.1.529) gali būti mažiau patogeniškas, palyginti su pradine paderme ir kitomis mutantinėmis padermėmis.
Nustatyta, kad omikrono mutantinė padermė neefektyviai panaudojo transmembraninę serino proteazę (TMPRSS2), tuo tarpu TMPRSS2 galėjo palengvinti viruso invaziją į šeimininko ląsteles, skaidydamas naujojo koronaviruso smaigalio baltymą. Tuo pačiu metu tyrėjai pastebėjo, kad omikrono replikacija žmogaus ląstelių linijose Calu3 ir Caco2 buvo žymiai sumažėjusi.

Vaizdo šaltinis internete

k18-hACE2 pelių modelyje, palyginti su originalia paderme ir Delta mutantu, omikronų replikacija sumažėjo tiek viršutiniuose, tiek apatiniuose pelių kvėpavimo takuose, o plaučių patologija buvo ne tokia sunki, o omikronų infekcija sukėlė mažesnį svorio kritimą ir mirtingumą nei originali padermė ir Alfa, Beta bei Delta mutantai.
Todėl tyrėjai padarė išvadą, kad pelėms sumažėjo omikronų replikacija ir patogeniškumas.

Vaizdo šaltinis internete

2022 m. gegužės 16 d. žurnalas „Nature“ paskelbė Yoshihiro Kawaokos, pirmaujančio Tokijo universiteto ir Viskonsino universiteto virusologo, straipsnį, kuriame pirmą kartą gyvūnų modelyje patvirtinama, kad „Omicron BA.2“ iš tiesų yra mažiau virulentiškas nei ankstesnė originali padermė.

Tyrėjai atrinko gyvus Japonijoje išskirtus BA.2 virusus, kad užkrėstų k18-hACE2 peles ir žiurkėnus, ir nustatė, kad po užkrėtimo ta pačia viruso doze tiek BA.2, tiek BA.1 užkrėstų pelių plaučiuose ir nosyje viruso titrai buvo žymiai mažesni nei pradinės New Crown padermės infekcijos atveju (p < 0,0001).

Šis auksinio standarto rezultatas patvirtina, kad „Omicron“ iš tiesų yra mažiau virulentiškas nei originalus laukinis tipas. Priešingai, po BA.2 ir BA.1 infekcijų gyvūnų modelių plaučiuose ir nosyse reikšmingo viruso titrų skirtumo nebuvo.

Vaizdo šaltinis internete

PGR viruso kiekio tyrimai parodė, kad tiek BA.2, tiek BA.1 infekuotų pelių plaučiuose ir nosyje viruso kiekis buvo mažesnis nei pradinės New Crown padermės pelių, ypač plaučiuose (p < 0,0001).

Panašiai kaip ir pelių atveju, BA.2 ir BA.1 užkrėstų žiurkėnų nosyje ir plaučiuose aptikti viruso titrai buvo mažesni nei pradinės padermės po „inokuliacijos“ ta pačia viruso doze, ypač plaučiuose, ir šiek tiek mažesni BA.2 užkrėstų žiurkėnų nosyje nei BA.1 – iš tikrųjų pusei BA.2 užkrėstų žiurkėnų plaučių infekcija neatsirado.

Taip pat nustatyta, kad pradinės padermės, BA.2 ir BA.1, po infekcijos neturėjo kryžminės serumų neutralizacijos – tai atitinka tai, kas pastebėta realiame pasaulyje žmonėms, užsikrėtusiems skirtingais naujais karūnos mutantais.

Vaizdo šaltinis internete

Realaus pasaulio duomenys: omikronas rečiau sukelia sunkią ligą

Keliuose iš aukščiau paminėtų tyrimų aprašytas sumažėjęs omikrono virulentiškumas laboratoriniuose gyvūnų modeliuose, bet ar tas pats pasakytina ir apie realų pasaulį?

2022 m. birželio 7 d. PSO paskelbė ataskaitą, kurioje įvertintas užsikrėtusiųjų Omikrono (B.1.1.529) epidemijos ir Delta pandemijos metu ligos sunkumo skirtumas.

Ataskaitoje pateikti 16 749 nauji koronarinės širdies ligos pacientai iš visų Pietų Afrikos provincijų, įskaitant 16 749 pacientus Deltos epidemijos metu (2021/8/2–2021/10/3) ir 17 693 pacientus Omikrono epidemijos metu (2021/11/15–2022/2/16). Pacientai taip pat buvo suskirstyti į sunkias, sunkias ir nesunkias ligas.

kritinė: jei buvo taikyta invazinė ventiliacija, arba deguonis ir didelio srauto transnazalinis deguonis, arba ekstrakorporinė membraninė oksigenacija (ECMO), arba buvo paguldyta į intensyviosios terapijos skyrių hospitalizacijos metu.
-sunkus (sunkus): hospitalizacijos metu gavo deguonies
-nesunkus: jei netenkinama nė viena iš aukščiau išvardytų sąlygų, paciento būklė nėra sunki.

Duomenys parodė, kad Delta grupėje 49,2 % atvejų buvo sunkūs, 7,7 % – kritiniai ir 28 % visų hospitalizuotų Delta infekuotų pacientų mirė, o Omikrono grupėje 28,1 % atvejų buvo sunkūs, 3,7 % – kritiniai ir 15 % visų hospitalizuotų Omikrono infekuotų pacientų mirė. Be to, vidutinė hospitalizacijos trukmė Delta grupėje buvo 7 dienos, palyginti su 6 dienomis Omikrono grupėje.

Be to, ataskaitoje analizuojami įtakos veiksniai – amžius, lytis, skiepijimo statusas ir gretutinės ligos – ir padaryta išvada, kad Omicron (B.1.1.529) buvo susijęs su mažesne sunkios ir kritinės ligos tikimybe (95 % PI: 0,41–0,46; p < 0,001) ir mažesne mirties ligoninėje rizika (95 % PI: 0,59–0,65; p < 0,001).

Vaizdo šaltinis internete

Tolesni tyrimai taip pat išsamiai išanalizavo skirtingų Omikrono potipių virulentiškumą.

Kohortos tyrime, atliktame Naujojoje Anglijoje, išanalizuoti 20 770 Delta atvejų, 52 605 Omicron B.1.1.529 atvejų ir 29 840 Omicron BA.2 atvejų. Nustatyta, kad mirčių dalis Delta atveju buvo 0,7 %, B.1.1.529 atveju – 0,4 %, o BA.2 atveju – 0,3 %. Atlikus korekciją dėl klaidinančiųjų veiksnių, tyrimo išvadose teigiama, kad mirties rizika BA.2 atveju buvo žymiai mažesnė, palyginti su Delta ir B.1.1.529.

Vaizdo šaltinis internete

Kitame Pietų Afrikoje atliktame tyrime buvo vertinama hospitalizacijos rizika ir sunkios baigties rizika sergant Delta, BA.1, BA.2 ir BA.4/BA.5. Rezultatai parodė, kad iš 98 710 naujai užsikrėtusių pacientų, įtrauktų į analizę, 3825 (3,9 %) buvo paguldyti į ligoninę, iš kurių 1276 (33,4 %) išsivystė sunki liga.

Tarp užsikrėtusiųjų skirtingomis mutacijomis, 57,7 % Delta užsikrėtusių pacientų išsivystė sunki liga (97/168), palyginti su 33,7 % BA.1 užsikrėtusių pacientų (990/2940), 26,2 % BA.2 (167/637) ir 27,5 % BA.4/BA.5 (22/80). Daugiamatė analizė parodė, kad sunkios ligos išsivystymo tikimybė užsikrėtusiems Delta > BA.1 > BA.2, o sunkios ligos išsivystymo tikimybė užsikrėtusiems BA.4/BA.5 reikšmingai nesiskyrė, palyginti su BA.2.
Sumažėjęs virulentiškumas, bet reikalingas budrumas

Laboratoriniai tyrimai ir realūs duomenys iš kelių šalių parodė, kad Omicron ir jo potipiai yra mažiau virulentiški ir rečiau sukelia sunkias ligas nei originali padermė ir kitos mutantinės padermės.

Vis dėlto 2022 m. sausio mėn. žurnalo „The Lancet“ numeryje pasirodžiusiame apžvalginiame straipsnyje „Švelnesnė, bet ne lengva forma“ pažymėta, kad nors omikrono infekcija sudarė 21 % visų jaunesnių Pietų Afrikos gyventojų hospitalizacijų atvejų, sunkią ligą sukeliančių protrūkių dalis greičiausiai padidės populiacijose, kuriose yra skirtingas užsikrėtimo lygis ir skirtingas vakcinacijos lygis. (Nepaisant to, šioje paprastai jaunoje Pietų Afrikos populiacijoje 21 % hospitalizuotų pacientų, užsikrėtusių SARS-CoV-2 omikrono variantu, pasireiškė sunki klinikinė eiga, o ši dalis gali padidėti ir turėti didelį poveikį protrūkių metu populiacijose, kuriose yra skirtinga demografinė sudėtis ir žemesnis infekcijos ar vakcinos sukelto imuniteto lygis.)

Minėtos PSO ataskaitos pabaigoje komanda pažymėjo, kad nepaisant sumažėjusio ankstesnės padermės virulentiškumo, beveik trečdaliui hospitalizuotų „Omicron“ (B.1.1.529) pacientų išsivystė sunki liga ir kad įvairūs nauji karūnos mutantai ir toliau sukėlė didelį sergamumą ir mirtingumą vyresnio amžiaus žmonėms, imunodeficito turintiems ar neskiepytiems žmonėms. (Taip pat norėtume įspėti, kad mūsų analizė neturėtų būti vertinama kaip patvirtinanti „lengvo“ varianto naratyvą. Beveik trečdaliui hospitalizuotų „Omicron“ pacientų išsivystė sunki liga, o 15 % mirė; šie skaičiai nėra nereikšmingi... Pažeidžiamose populiacijose, t. y. itin vyresnio amžiaus pacientams, populiacijose, kuriose yra didelė gretutinių ligų našta, silpniems pacientams ir tarp neskiepytų, COVID-19 (visi LOJ) ir toliau prisideda prie didelio sergamumo ir mirtingumo.)

Ankstesni „Omicron“ duomenys, gauti Honkonge sukėlus penktąją pandemijos bangą, parodė, kad 2022 m. gegužės 4 d. penktosios bangos metu iš 1 192 765 naujai užsikrėtusiųjų mirė 9115 žmonių (apytikslis mirtingumo rodiklis – 0,76 %), o apytikslis mirtingumo rodiklis tarp vyresnių nei 60 metų žmonių buvo 2,70 % (apie 19,30 % šios amžiaus grupės buvo neskiepyti).

Tuo tarpu tik 2 % vyresnių nei 60 metų Naujosios Zelandijos gyventojų yra neskiepyti, o tai labai koreliuoja su mažu apytiksliu 0,07 % mirtingumu naujosios karūnos epidemijos metu.

Kita vertus, nors dažnai teigiama, kad Niukaslas ateityje gali tapti sezonine, endemine liga, yra akademinių ekspertų, kurie laikosi kitokios nuomonės.

Trys mokslininkai iš Oksfordo universiteto ir Europos Sąjungos jungtinio tyrimų centro mano, kad mažesnis Omikrono sunkumas gali būti tiesiog sutapimas ir kad nuolatinė sparti antigeninė evoliucija gali sukelti naujų variantų.

Kitaip nei imuninis pabėgimas ir perdavimas, kuriems evoliucinis spaudimas daro didelį poveikį, virulentiškumas paprastai tėra evoliucijos „šalutinis produktas“. Virusai evoliucionuoja siekdami maksimaliai padidinti savo gebėjimą plisti, ir tai taip pat gali padidinti virulentiškumą. Pavyzdžiui, padidinus viruso kiekį, siekiant palengvinti perdavimą, liga vis tiek gali sunkėti.

Negana to, virulentiškumas padarys labai ribotą žalą viruso plitimo metu, jei viruso sukelti simptomai pasireiškia daugiausia vėlesniame infekcijos etape – kaip gripo virusų, ŽIV ir hepatito C virusų atveju, kurie turi daug laiko išplisti, kol sukelia rimtų pasekmių.

Vaizdo šaltinis internete

Tokiomis aplinkybėmis gali būti sunku numatyti naujos karūnos mutantinės padermės tendencijas pagal mažesnį Omicron virulentiškumą, tačiau gera žinia yra ta, kad naujoji karūnos vakcina parodė sumažėjusią sunkios ligos ir mirties riziką prieš visas mutantines padermes, o agresyvus populiacijos skiepijimo rodiklių didinimas išlieka svarbiu būdu kovoti su epidemija šiame etape.
Padėkos: Šį straipsnį profesionaliai peržiūrėjo Panpan Zhou, Tsinghua universiteto Medicinos mokyklos daktaras ir Scripps tyrimų instituto podoktorantūros bendradarbis, JAV.
„Omicron“ antigeno savikontrolės reagentas namams